Vỏ nhôm iPhone 6s đã được sử dụng vật liệu nhôm 7000 Series được sử dụng trong ngành giá công nghiệp hàn không vũ trụ cứng hơn rất nhiều so với iPhone 6. iPhone 6s còn có phiên màu vàng giá iPhone 6 cũ hồng mới bên cạnh 3 phiên bản màu sắc trước đó là xám, bạc và cũ vàng. Ngoài ra cấu hình của iPhone 6s cũng được cải tiến mới hơn khi trang bị cảm biến 3D Touch, cho phép hình ảnh, email, tin nhắn hiển thị dưới dạng pop up trên màn hình. Ngoài ra iPhone 6s được trang bị chip A9 được giới thiệu là nhanh và mạnh hơn chip A8 trước đó rất nhiều. Hiệu năng CPU hơn 70% và hiệu năng đồ họa GPU nhanh hơn 90% sẽ cho bạn trải nghiệm những ứng dụng game nặng 1 cách mượt mà .
Camrea trên iPhone 6s chính là sự cải tiến nổi bật trên iPhone 6s .Camera chính của iPhone 6s là 12 MP, camera phụ 5 MP, iPhone 6s còn được bổ sung thế hệ Touch ID thế hệ thứ hai. Đáng chú ý, màn hình phía trước có thể tự động bật sáng hơn 3 lần để tạo ánh sáng cho các bức hình chụp selfie thay vì tích hợp đèn flash ra phía trước.
Tính năng Live Photos trên iPhone 6s giúp iPhone 6s sẽ tự động quay trước và sau thời điểm chụp hình một đoạn video khoảng 3 giây. Thay vì chỉ xem ảnh tĩnh, người xem có thể xem lại các khoảnh khắc ngắn trước và sau khi chụp.
iPhone 6s còn được trang bị tính năng 3D Touch, có thể nói đây là thay đổi đáng kể trong lịch sử iPhone iPhone. Màn hình cảm ứng lực của iPhone 6s/6s Plus cho phép người dùng nhấn với lực khác nhau để mở nhanh các shortcut, xem trước nội dung tin nhắn, email hay hình ảnh. 3D Touch trên iPhone và Force Touch trên MacBook hoạt động như nhau, nhưng độ nhạy với lực chạm vào màn hình trên iPhone ở mức cao hơn.
3D Touch giúp bàn phím ảo trên iPhone 6s và 6s Plus có thể biến thành bàn rê giá chuột. Kích hoạt tính năng này bằng cách bấm cũ mạnh vào bàn phím. Lúc này bạn vuốt đến các vị trí để di giá iPhone 5 cũ chuyển con trỏ chuột. Ngoài ra còn có thể bấm giữ ở mức vừa để chọn iPhone 5 đoạn văn bản.
iPhone 6s có thêm phiên bản vàng hồng và theo một chuyên gia dự đoán 98% lý do người tiêu dùng mua iPhone 6S là vì màu sắc này. Màu vàng hồng (rose gold) – trong suy nghĩ của người dân New York – là đại diện cho thời trang vì theo họ vàng hồng là màu thời thượng. Màu vàng hồng thêm vào đó một chút gia vị. Với chiếc iPhone 6s màu vàng hồng – nó trông thực sự ấn tượng. Nói cách khác chính là lựa chọn cho những người đã cảm thấy đủ với màu vàng truyền thống.
Hầu hết hệ thống bán lẻ điện thoại lớn đã công bố giá bán dự kiến iPhone 6S/6S Plus chính hãng tại Việt Nam. Tuy nhiên, mức giá mà các đơn vị này đưa ra không giống nhau, có những nơi chênh lệch đến 400 nghìn đồng.
iPhone 6S đã chính thức được ra mắt với thiết kế không khác biệt so với iPhone 6. Điểm khác biệt về ngoại hình là bộ đôi Phone 6s và 6s Plus sẽ có tới 4 màu sắc bao gồm: xám, bạc, vàng và vàng sim ghép hồng, và có thêm chữ “S”phía sau mặt lưng . iPhone 6s sẽ nặng hơn iPhone 6 14g, iPhone 6s dài, sim ghép iPhone 6S dày, rộng hơn iPhone 6 chút ít, nhưng người ta khó nhận ra bằng mắt thường bởi con số này chỉ tính iPhone 6S là một vài mm, thậm chí chưa đến 1 mm.